Ugly Alert menceritakan tentang seorang pria bernama Gong Joon-soo (Im Joo-hwan) yang berpura-pura menjadi pembunuh untuk melindungi adik angkatnya yang dituduh sebagai pembunuh. Ia pun dipenjara.

Selepas dari penjara, Joon-soo bekerja di sebuah perusahaan fesyen yang menjadi bagian dari BY Group. Di tempat tersebut, ia bertemu dengan Na Do-hee (Kang So-ra) seorang gadis workaholic yang menutupi identitasnya sebagai pewaris dari perusahaan kakeknya.